SMP Negeri 1 Bongomeme kembali menjadi bagian dari program nasional Merdeka Belajar Kampus Merdeka (MBKM) melalui pelibatan Tim Program Magang dan Studi Profesi (PMS) dari Lembaga Penjaminan Mutu Pendidikan (LP3M) Universitas Negeri Gorontalo. Kegiatan ini merupakan bagian dari PMS MBKM Batch 7, yang resmi ditarik ke sekolah pada 31 juli 2025, sebagai wujud kolaborasi antara perguruan tinggi dan satuan pendidikan menengah.